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　　1.行政管理系統

　　在醫院信息系統中，醫院行政管理子系統涉及醫院的各科室的行政管理，主要包括人事管理系統、財務管理系統、后勤管理系統、藥庫管理系統、醫療設備管理系統、門診和手術及住院預約系統、病人住院管理系統等。

　　2.醫療管理系統

　　醫療管理系統主要是醫院涉及的醫療業務方面的信息處理，主要包括門診、急診管理系統，病案管理系統，醫療統計查詢系統，血庫管理系統等。

　　3.決策支持系統

　　決策支持系統主要是有關醫療業務質量等方面的處理，包括醫療質量評價系統、醫療質量控制系統等。

　　4.其他各種輔助系統

　　除了以上的行政管理系統、醫療相關業務處理系統，還有其他的輔助系統，如醫療情報檢索系統、醫療數據庫系統等。