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診斷型電子十二指腸鏡：

這種類型的十二指腸鏡主要用于胰膽管檢查。其視野角度設計為側視鏡，能夠正面觀察十二指腸乳頭部。主要由光學系統、先端部、彎曲部、插入部、鉗部組成，在內鏡先端部包括觀察窗、導光窗、送氣送水孔、附件出口及抬鉗器等結構。

治療型電子十二指腸鏡：

與診斷型相比，治療型電子十二指腸鏡的頭部直徑和彎曲部直徑略大，這使得其內徑通道更大，便于各種手術器械的插入及操作。主要用于壺腹部、膽道及胰腺疾病的治療，可以進行乳頭括約肌的切開、胰膽管支架置入、結石取出、胰膽管引流等鏡下治療。

傳統電子十二指腸鏡：

通過鏡頭將目視圖像傳送到顯微鏡中，然后進行觀察和判斷。

全息電子十二指腸鏡：

可以將目視信息傳送到改良后的全息顯示器上，使醫生能夠觀察未被放大的三維圖像，使病灶信息更加豐富和清晰。

一次性十二指腸鏡：

近年來，為了減少交叉感染和提高患者安全性，一次性使用的十二指腸鏡被開發出來。這種類型的十二指腸鏡無需再處理或修理，簡化了工作流程，并且始終保持無菌狀態。

國產電子十二指腸鏡：

國內企業也研發出了電子十二指腸鏡，如深圳開立生物醫療科技股份有限公司推出的ED-5GT電子十二指腸內窺鏡，這是國產獲批的首臺電子十二指腸內窺鏡。