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選擇醫院信息系統最重要的是選擇合作伙伴。信息化建設是持續的。如果選擇了錯誤的合作伙伴，不僅會導致投資損失，更重要的是，還會導致系統故障、醫院管理混亂、競爭力下降。供應商的選擇主要考慮以下幾個方面：

（1） 經濟實力

是否有足夠的資金來滿足實施信息系統的服務要求。

（2） 專業背景

醫療行業的背景是什么，是否熟悉醫院的管理模式和業務流程，能否把握醫院的實際需求，能否有效幫助醫院解決問題，是否有專業的信息化建設項目實施方法和經驗。

（3） 技術實力

是否有能力掌握特定的信息系統技術，管理大型集成軟件的實施和管理，并能提供及時高效的技術支持。

（4） 可持續發展能力

能否根據醫院的需要，在管理、技術等方面不斷創新，適應醫院發展變化的要求。

（5） 管理咨詢能力

能站在醫院的立場上，幫助他們解決信息技術實施過程中出現的新問題嗎。

（6） 實施能力

是否有特定的成功項目實施經驗，并專注于該行業？項目管理能力如何。

（7） 醫院信息化建設能否實現平穩過渡。

（8） 售后服務能力

供應商能否為醫院提供長期全面的維護和升級服務。